専門家によるキュレーションと生物学的な関連性
各パネルは、データドリブン型のアプローチとその分野の専門家の意見に基づいて慎重にデザイン
柔軟な適合性
パネルは新鮮凍結組織またはFFPE組織のどちらにも対応しており、また、アッセイは組織の形を維持し、Xenium処理後にHE染色またはIF染色を行うことが可能
導入が容易
評価済みのパネルは最適化の必要がなく、時間と貴重なサンプルを節約できるため、研究者の実験に集中することが可能
多様なパネルメニュー
フォーカスされたパネルは、さまざまな組織タイプにわたって関連する基礎生物学的情報を捕捉し、合理的なデータ解析と迅速な回答を実現
カスタム化性
どのパネルにも、最大で100種のカスタムターゲットを簡単に追加できるため、特定の研究目的に対応可能
高パフォーマンス
高い感度と特異性をもたらす独自のケミストリーとプローブデザインによって、信頼性の高い結果を取得
実現できること
それぞれの細胞のストーリーを知る
新鮮凍結（FF）組織およびFFPE組織に含まれる細胞のユニークな遺伝子シグネチャーを、シングルセルおよび細胞内の解像度で探索します。
発生から健康、疾患までの細胞の関わりを明らかにする
健康および疾患という状況に関して、細胞機能に影響を及ぼす細胞間の相互作用や細胞同士の関係を明らかにします。
変化し続ける細胞状態を固定して保存
薬剤処理や遺伝子編集などに反応してサンプルが急速に変化するような、短いタイムスケールの研究を行うことが可能
ChromiumおよびVisiumの実験で得られた知見を検証する
キーとなるターゲットの遺伝子発現マップを細胞内の解像度で構築することで、全トランスクリプトーム技術で発見された生物学的機序を精密化して検証します。
ターゲットを絞りカスタム化可能なパネル
ヒト乳腺遺伝子発現パネル
乳腺組織の高解像度での細胞タイピングや、腫瘍微小環境を含む乳がんの病態の特性解析に最適です。- ヒト乳腺組織の細胞種および細胞状態をターゲットとするために約280遺伝子を選出
- 最大100遺伝子をカスタム化し、合計380遺伝子とすることが可能
- お客様から直接インプットされた、豊富な公開シングルセルデータセットを利用してデザイン
マウス脳遺伝子発現パネル
マウス脳組織の高解像度での細胞タイピングに最適です。- マウス脳研究用として、細胞種および細胞状態をターゲットとするために約248遺伝子を選出
- 最大100遺伝子をカスタム化し、合計348遺伝子とすることが可能
- お客様から直接インプットされたシングルセルデータセットを利用してデザイン
パネルの幅広いロードマップ
組織パネルおよびアプリケーションパネルのメニューがさらに充実します。ご期待ください。- ヒト脳
- 肺
- 皮膚
- 腎臓
- 膵臓
- More to come!
エンドツーエンドソリューション
Xenium In Situの試薬
キュレーション済みの多様なパネルメニューの中から選択し、さらに研究ニーズに合わせてカスタム化が可能
空間情報の専門家チーム
10x Genomicsの専門家チームが電話やメールでサポート
High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue
High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue
Janesick A, et al. bioRxiv (2022).
Janesick A, et al. bioRxiv (2022).
Interactive dataset
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Interactive data visualization for human breast panel
Interactive data visualization for human breast panel
Xenium Analyzer: In situ profiling—just the right scale, in the right place
Xenium Analyzer: In situ profiling—just the right scale, in the right place
Grant application resources
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Xeniumの参考資料
参考資料
現在販売中のXenium In Situ遺伝子発現パネルはこちらからご覧ください。
High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue
High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue
Janesick A, et al. bioRxiv (2022).
Janesick A, et al. bioRxiv (2022).
Interactive dataset
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Interactive data visualization for human breast panel
Interactive data visualization for human breast panel
Xenium Analyzer: In situ profiling—just the right scale, in the right place
Xenium Analyzer: In situ profiling—just the right scale, in the right place
Grant application resources
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よくある質問
Xeniumではバリデーション済みのRNAパネルによって、ヒトやマウスの組織に含まれる数百のRNAターゲットを解析します。これはプローブベースのアッセイであり、3' ポリ（A）による捕捉を使用しないため、大部分のRNA種を検出することができます。将来的には、Xeniumは数千種のターゲットを解析する能力を持つことでしょう。
Xeniumパネルは、新鮮凍結組織とFFPE組織の両方に対応する統一されたアッセイで構成されています。さらに、使用されているケミストリーが穏やかであるため、Xenium処理後に組織をHE染色やIF染色に用いることができます。
Xeniumはサンプルをダメージすることのない解析であるため、Xeniumで解析したものと同一の組織切片をHEイメージング用に染色したり、Visiumを用いた全トランスクリプトーム解析などの下流アッセイを実行したりすることが可能です。
Xeniumアッセイは、Xenium Analyzerにロードするまでに3時間程度のハンズオンタイムを必要とし、最短で2日程度かかります。
はい、各パネルに最大100種のターゲットをカスタムで追加することができます。10x Genomicsの既製アッセイに用いられているのと同じデザインプロセスで、カスタムターゲット用のプローブを設計することができます。
