高通量单细胞分析
捕获样本中成千上万个细胞的完整异质性。
多组学细胞读数
可检测3’ mRNA、细胞表面蛋白、CRISPR扰动及其他。
可扩展的功能基因组学
通过配对的CRISPR敲除和全转录组读数来探索基因网络。
简化的数据分析
使用易用的软件来探索和解释单细胞基因表达谱。
为期一天的实验室流程
在一天之内完成从样本到可测序文库的过程。
兼容不同的样本
经验证适用于固定、新鲜和冷冻的样本，以及完整的细胞和细胞核。
探索您的应用
鉴定复杂的细胞群体
发现新的细胞类型和状态
揭示复杂的细胞过程
可扩展的功能基因组学
灵活的解决方案 满足您各种需求
单细胞基因表达的标准
获得初步见解
开启您的单细胞基因表达实验--使用可以负担的适用于小型项目的解决方案进行试点研究或优化实验条件。
多组学分析
同时测量细胞表面蛋白表达或CRISPR扰动与3’基因表达。
- 筛选与疾病相关的新型基因靶点或耐药性的驱动因素
- 通过更快的流程和更高的分辨率开展功能性遗传筛选
- 揭示发育过程中复杂的基因调控通路
大规模项目
处理您最雄心勃勃的项目，从药物筛查到临床前试验，并为大型项目提供补充解决方案。
加快获得结果的时间在单张芯片中一次分析数十万个单细胞，多达 16 个样本。
- 通过更大规模的实验来享受经济的检测
通过结合3’ CellPlex进行混样分析和靶向基因表达，降低实验和分析成本，并完成您最重视的项目。
- 提供从样本制备到结果分析的完整方案
从技术资源到用户友好的基于云的数据分析工具，您都可以获得端到端的支持。
- 扩大规模
在靶向扩增的过程中，通过多文库混合扩增，最大限度地提高样本通量并缩短手动操作时间。
- 无缝整合
不错过任何数据，在全转录组和来自同一文库的靶向分析之间无缝转换。
- 关注重点
随着研究规模的扩大，通过使用预先设计或定制的靶向基因组合降低测序成本，最大限度地利用预算。
自动化工作流程
通过Chromium Connect单细胞基因表达解决方案获得一致性高、重复性好的结果，最大限度地提高实验室生产力。
自动化单细胞基因表达解决方案
基于Chromium Connect的自动化基因表达工作流程，助力您探索细胞异质性，发现新的目标和生物标志物，并以提高生产力来揭示复杂的细胞过程。
- 优化生产力
缩短手动操作时间，从单细胞到可以测序的基因表达文库，实现无人值守的便捷。
- 将您的工作流程标准化
在多个实验室、用户、甚至多个站点生成一致且可重复的单细胞基因表达结果。
- 流线操作
采用预先分装的自动化专属试剂，这些试剂采用颜色编码和2D条形码，用于防错试剂跟踪和加载。
经过验证的结果
文献
Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells
Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells
Nature Communications. 2017, Grace X Y Zheng, et al.
Nature Communications. 2017, Grace X Y Zheng, et al.
Colonic epithelial cell diversity in health and inflammatory bowel disease
Colonic epithelial cell diversity in health and inflammatory bowel disease
Nature. 2019, Kaushal Parikh, et al.
Nature. 2019, Kaushal Parikh, et al.
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes
Nature. 2019, Daniel T Montoro, et al.
Nature. 2019, Daniel T Montoro, et al.
资源
查找有关Chromium单细胞基因表达的最新应用指南及其他文档
Getting Started with Gene Expression Guide
Getting Started with Gene Expression Guide
Experiment Planning Guide, 10x Genomics
Experiment Planning Guide, 10x Genomics
Grant Application Resources for Chromium Single Cell Gene Expression
Grant Application Resources for Chromium Single Cell Gene Expression
Grant Application Resources, 10x Genomics
Grant Application Resources, 10x Genomics
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Improving Single Cell Characterization with Simultaneous Gene Expression and Cell Surface Protein Measurements at Scale
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
Pushing the Boundaries of Gene Sensitivity with the Chromium Single Cell Gene Expression v3
Pushing the Boundaries of Gene Sensitivity with the Chromium Single Cell Gene Expression v3
Application Note, 10x Genomics
Application Note, 10x Genomics
完整的解决方案
Chromium单细胞基因表达试剂
利用我们的试剂盒，您可以捕获和扩增3’ mRNA，鉴定CRISPR扰动或开展其他应用。
工作流程
单细胞基因表达的基本工作流程如下所示。若您使用我们的Feature Barcode试剂盒来分析CRISPR或细胞表面蛋白，我们将会提供其他方案用于修饰您感兴趣的蛋白。
- 2
文库构建
利用我们的试剂盒和Chromium Controller构建带有10x条形码的文库。 Chromium Controller将每个带有10x条形码的凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中，细胞经过逆转录生成cDNA，其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。
资源 - 3
- 4
数据分析
我们的Cell Ranger分析软件可生成每个细胞的表达谱，鉴定表达谱相似的细胞簇，还能够对多个样本的数据进行合并分析。
分析流程输出
输出结果包括质控信息和文件，这些文件可轻松用于Loupe可视化软件或第三方R工具及Python工具的进一步分析。
资源 - 5
数据可视化
利用我们的Loupe Browser可视化软件，您可以交互式地探索实验结果，研究目的基因的表达模式，确定细胞类型，并开展细胞簇和样本之间的比较分析。
只有生物信息专家才能使用吗？
Loupe是点选式软件，任何人都可以轻松下载和使用。
资源
常见问题
它提供了一种全面的方法，来分析基因表达（全转录组或靶向），以及细胞表面蛋白或CRISPR编辑对复杂生物学的多维见解。
只要是表达聚腺苷酸化mRNA分子的细胞类型，都与该单细胞RNA-seq流程兼容。
Chromium单细胞基因表达与新鲜、固定（甲醇）和冷冻的单细胞或单细胞核悬液兼容。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。
10x Genomics提供了两种类型的软件，可帮助您分析数据：Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger这款分析软件能够自动生成每个细胞的表达谱，并鉴定表达谱相似的细胞簇。随后，您可以利用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。您可以从10x支持网站上免费下载Cell Ranger和Loupe Browser。
我们在内部测试了直径最大达到30微米的细胞。此外，许多客户文献也成功证明了对各类细胞的兼容性，如肝细胞、成纤维细胞和心肌细胞，它们的大小往往超过30微米。
