“是什么限制了生物学、生物医学的进步?是技术。每当有新技术出现时,科学就会向前迈进一大步。”
-George Church
工作原理
通过Xenium原位分析来构建亚细胞空间图谱
Xenium平台采用基于探针的策略,实现高度特异且灵敏的RNA靶点检测。这些探针是利用10x Genomics专有的算法设计的,可确保不存在探针串扰。
样本处理过程从在Xenium载玻片上制备组织切片开始。对切片进行处理,使得RNA暴露并能够被可环化DNA探针标记。探针连接后产生环状DNA探针,环状探针通过酶促扩增并与荧光标记寡核苷酸结合,产生明亮的、易于成像且具有高信噪比的信号。将最多两张载玻片放置在Xenium分析仪内,样本在其中经历连续几轮的荧光探针杂交、成像和去除,从而生成每个基因特异性的光学特征,实现目标基因的鉴定。最后构建出整张组织切片上转录本的全景空间图谱。
分析数据
- 使用Xenium Explorer Demo(即将推出的桌面应用程序的预览版)来分析人类乳腺癌样本的Xenium原位分析数据集,这些数据是利用280个基因的Xenium人类乳腺基因表达Panel附加33个额外的定制基因分析所得。