「生物学や生物医学の発展を阻むものは何でしょうか？それはテクノロジーです。科学は、新しいテクノロジーが現れるたびに大きな飛躍を遂げています。」
-George Church
どのように機能するか
Xenium In Situによる細胞内空間マップの構築
Xeniumプラットフォームは、プローブベースの戦略によって、RNAターゲットを高い特異性と感度で検出します。プローブは、プローブ間のクロストークがないように、10x Genomics独自のアルゴリズムでデザインされています。
サンプル処理は、組織切片をXeniumスライドに載せることから始まります。切片を処理し、環状化可能なDNAプローブでRNAを標識します。プローブをライゲーションすることで、環状のDNAプローブが生じ、これが酵素で増幅されて蛍光オリゴと結合することで、S/N比が高く、明瞭でイメージングしやすいシグナルが生成されるのです。その後、最大2枚のスライドをXenium Analyzerにセットし、蛍光プローブのハイブリダイゼーション、イメージング、除去を連続して行います。各遺伝子に固有の光学的シグネチャーが生成され、ターゲット遺伝子の特定が可能になります。最終的に、組織切片全体にわたる転写物の空間マップを構築します。
データの探索
- Xenium Explorer Demo（近日公開予定のデスクトップアプリケーションのプレビュー）を使用して、ヒト乳がんサンプルのXenium In Situデータセットを、280遺伝子からなるXenium Human Breast Gene Expression Panelと33の追加カスタム遺伝子を用いて探索できます。
エンドツーエンドのXeniumプラットフォーム
空間的解析の専門家チーム
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