Visium空間的遺伝子発現ワークフローはほとんどの蛍光イメージングシステムと互換性があるため、検出できるタンパク質ターゲットの数は、抗体の選択とイメージングの構成に依存します。4つまでのIFマーカーをサポートしており、チャネルの1つにDAPIを使用することを推奨しています。詳細については、イメージングガイドライン（FFPE/新鮮凍結）をご参照ください。

はい。標準的なIFとVisiumで使用されるIFプロトコールでは重要な違いがいくつかあります。その他の詳細については、IFプロトコール（FFPE/新鮮凍結）をご参照ください。

Visiumアッセイは感度が高いため、Visiumの性能への影響は組織ごとに異なります。しかし、遺伝子発現の空間的な構成や細胞クラスターの検出はH&EとIFで同程度です。

Visiumは、mRNAを含む新鮮凍結組織およびFFPE組織に対応しており、新鮮な凍結組織とFFPE組織に対して異なる化学的性質を利用する個別のキットを用意しています。Visiumアッセイで社内試験に成功した組織のリストは、以下の通りです。

社内試験成功した組織：FFPE組織 | 新鮮凍結組織

10x Genomicsでは、Space RangerとLoupe Browserというデータ解析に役立つ2種類のソフトウェアを用意しています。Space Rangerは、組織画像上に空間的な遺伝子発現情報を自動的に重ね合わせ、スポット単位で転写プロファイルの類似性からクラスターを識別する解析ソフトウェアです。その後、視覚化ソフトウェアであるLoupe Browserを使い、結果をインタラクティブに探索することができます。Space RangerとLoupe Browserは、10xサポートサイトから無償でダウンロードできます。