Resources:
全面提升您的见解
将蛋白、总mRNA和形态学分析相融合，更深入、更完整地评估您的样本。
分析整张组织切片
观察蛋白检测和全转录组表达，而无需选择感兴趣的区域。
触手可及的技术
使用标准的显微镜、免疫荧光染色操作以及抗体。
简化的数据分析
通过易用的软件将蛋白检测结果与基因表达数据相结合。
加速科学的发现
每次运行最多可并行处理四个样品，从而更快地获得结果。
兼容更多样本类型
兼容FFPE或新鲜冷冻组织样本。
探索您的应用
全面了解疾病复杂性
发现新的生物标志物，并鉴定新的细胞类型和状态
定位细胞图谱的空间结构
鉴定基因表达的时空模式
丰富的见解
- 追溯过去——将新的生物标志物应用于存档的FFPE样本，揭秘过去隐藏的组织生物学特性
- 多组学分析——通过对单个组织切片的蛋白质和mRNA进行空间多组学分析，从而更全面地表征异质性
- 强大的发现-通过蛋白质检测和全转录组分析来设想新发现的细胞类型、状态和生物标志物的空间组织结构
久经考验的结果
文献
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
Maynard KR, et al. Nature (2021).
Maynard KR, et al. Nature (2021).
Mapping the developing human immune system across organs
Mapping the developing human immune system across organs
Suo C, et al. Science (2022).
Suo C, et al. Science (2022).
Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer
Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer
Qi J, et al. Nature Communications (2022).
Qi J, et al. Nature Communications (2022).
完整的解决方案
Visium空间组织优化玻片
可在现有的实验室基础设施中轻松使用，而无需购买新仪器。
Visium空间基因表达试剂
使用我们的试剂盒，您可以捕获整张组织切片上的全转录组基因表达和空间分布信息。
世界级的技术支持和客户支持
您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。
工作流程
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组织透化和文库构建
对组织进行透化处理，从细胞中释放出mRNA，这些mRNA与点上带有空间条形码的寡核苷酸相结合。通过逆转录反应从捕获的mRNA中生成cDNA。将带有条形码的cDNA合并后进行下游处理，制备出可立即测序的文库。对于FFPE组织，组织被透化，以便从细胞中释放连接的探针对，其中这些探针对与存在于点上的空间上条形码寡核苷酸结合。通过延伸反应添加空间条形码。然后把条形码标记的分子合并后进行下游处理，以生成可用于测序的文库。
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数据分析和可视化
Space Ranger分析软件可处理您的空间基因表达数据，而Loupe Browser可视化软件可帮助您交互式地探索实验结果。
只有生物信息学家才能使用Loupe吗？
Loupe是点选式软件，任何人都能轻松下载和使用。
资源
常见问题
是的，与Visium结合使用的IF方案与标准的IF方案有几个主要差别。请参阅IF演示方案，了解详细信息。
由于Visium分析的灵敏度高，IF对Visium性能的影响可能因组织而异。不过，H&E和IF之间的基因表达空间结构和细胞簇检测具有可比性。
10x Genomics提供了两种类型的软件，可以帮助您分析数据：Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger这款分析软件能够自动地将空间基因表达信息与组织图像相叠加，鉴定出转录图谱相似的数据点集合。随后，您可以采用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。Space Ranger和Loupe Browser可从10x Genomics支持页面上免费下载。
