Chromium 细胞核分离方案

简化工作流程以消除样本制备的复杂性

可便捷高效地制备冷冻样本,用于单细胞核测序,简化用户的实验过程,并改善更多样本的获得途径。确保用统一的样本制备工作流从多种组织类型获得可靠结果,同时还可优化该工作流程后与Chromium基因表达和染色质可及性分析共用。

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细胞核分离方案

Resources:

  • 今天即可开始使用

    易于使用,无需了解单细胞测序专业知识。

  • 节约宝贵时间和珍贵样本

    排除了组织解离和细胞核分离中的不确定因素。

  • 结果可靠

    可靠的标准化试剂专为10x Genomics单细胞分析而设计。

解析真正的组织成分

通过保留在新鲜组织解离过程中经常丢失的细胞,更全面地表征组织的异质性。利用简化的细胞核分离,避免会导致基因表达改变并产生细胞类型偏倚的长时间酶孵育过程。

揭示基因调控机制

采用细胞核捕获基因表达和染色质可及性信息,探究推动细胞分化、发育和疾病的基因调控相互作用。

保持用户样本的生物学状态

及时冻存用户样本,保持生物学状态。将样本运送到核心研究机构进行制备,或存储样本以备后续使用,最大限度减小基因表达的变化。

拓展用户存储样本的能力

运用新的单细胞技术再次评价生物库中保存的冷冻组织,并解决历史遗留的尚未得到解决的科学问题。

可靠的结果

观看客户如何使用Chromium单细胞核分离试剂盒。

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视频

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资源

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Sample preparation for single cell applications in oncology

Sample preparation for single cell applications in oncology

Sample Preparation Guide, 10x Genomics

Sample Preparation Guide, 10x Genomics

Sample preparation optimization guide with Single Cell Gene Expression LT

Sample preparation optimization guide with Single Cell Gene Expression LT

Sample Preparation Guide, 10x Genomics

Sample Preparation Guide, 10x Genomics

Rapid, scalable isolation of human tumor nuclei for single cell genomics

Rapid, scalable isolation of human tumor nuclei for single cell genomics

Poster, AACR

Poster, AACR

我们的端对端解决方案

细胞核制备

一体化试剂盒利用标准实验室设备,无需专门的仪器。

选择您的单细胞分析方法

细胞核可用于捕获染色质可及性或整体转录组基因表达图谱。

数据分析与可视化软件

数据分析软件

数据可视化软件

世界级技术与客户支持

可通过电话或email联系我们的专家支持团队。

工作流程

向下滚动查看用于Chromium细胞核分离的基本工作流程。

  1. 1Step 1

    获的样本

    从用户感兴趣的冻存组织开始。可兼容样本类型包括小鼠心脏、肝脏、大脑和多种人肿瘤。

    参考资料
  2. 2Step 2

    解离冻存组织

    使用提供的研棒和裂解缓冲液将冻存组织碾碎形成均匀的混合液。

    参考资料
  3. 3Step 3

    分离细胞核

    将均质化的组织通过提供的离心柱,以从破碎的样本中分离出细胞核。

  4. 4Step 4

    去除细胞碎片

    使用所提供的细胞碎片清除液和缓冲洗涤液纯化细胞核悬液

  5. 5Step 5

    重悬细胞核与QC

    在建议的重悬缓冲液中重悬细胞核,检查细胞核质量,接着进行所选择的单细胞分析。

    参考资料

常见问题

我们用下列冻存组织对Chromium细胞核分离试剂盒做了验证:小鼠心脏、肝脏、大脑、肺脏、肾脏、小肠和多种人类肿瘤。在该网站可以查阅所测试组织的最新列表:10x Genomics支持网页。该试剂盒与细胞悬液、植物或昆虫材料、钙化组织或FFPE组织不兼容。

所支持的组织用量范围为每个组织解离柱3-50mg。对于更大的组织块,需要将这些组织切成不大于50mg的碎块,并采用多个组织解离柱,在最后一步合并细胞核。对<3mg的组织块也有可能进行分析,但产率却决于组织类型。

获得较纯的细胞核悬液所需的所有试剂耗材均包含于该试剂盒中,采用标准实验室设备。不需要专门的仪器。

可兼容的单细胞分析包括Chromium单细胞ATAC、单细胞多组学ATAC + 基因表达、单细胞基因表达和固定RNA分析。遵照细胞核重悬建议进行用户正在运行的特定分析。不需要对单细胞工作流程做任何改动。

10x Genomics提供数据分析与可视化软件,帮助用户分析自己的单细胞数据。遵照分析建议进行感兴趣的单细胞分析。对于单细胞基因表达分析,确保分析过程中包括内含子。用户可从10x Genomics支持网页免费下载Cell Ranger和Loupe Browser软件。

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单细胞多组学ATAC + 基因表达

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单细胞基因表达

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单细胞基因表达Flex

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性能

  • 通过开放染色质分析进行表观基因组学研究
  • 在同一个单细胞核中进行转录组和开放染色质的联合分析
  • 3’转录组基因在组织中的表达
  • 靶向基因表达
  • 多样本混合检测
  • Whole transcriptome gene expression

扩展应用

  • 细胞表面蛋白
  • CRISPR筛选
  • 多样本混合检测
  • 细胞表面蛋白

仪器

  • Chromium X系列单细胞系统
  • Chromium Controller
Single Cell Gene Expression

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